Desde el 2021, luego de la Pandemia del Covid 2019, a través de Alianzas Estratégicas con la Dirección de Inclusión Social (DIS) de la M. Ilustre Municipalidad de Guayaquil, el Instituto  provee de servicios tales como: Evaluación Diagnóstica, Atención Integral especializada en Psiquiatría y Neurología, Entrega de Medicamentos de Especialidad a  niños, niñas, adolescentes y adultos con y sin discapacidad, derivados por la DIS.

A partir del 2020, la JBG y la CHD suscribieron un convenio de colaboración para la atención de alrededor de 26 pacientes del Instituto, todos en situación de abandono, con enfermedades crónicas y con altos porcentajes de discapacidad.  La CHD les brinda, no sólo albergue, vestuario, suministros de higiene, etc., sino una estadía humanizada con todos los cuidados que una persona con discapacidad física y mental en etapa terminal requiere.